Madrasah Aliyah Negeri 1 Kota Semarang didirikan pada tahun 1978 sebagai lembaga pendidikan penerus dari lembaga pendidikan sebelumnya yakni Sp IAIN Sunan Kalijaga dengan SK Menteri Agama Nomor 17 tahun 1978.

Madrasah Aliyah Negeri 1 Kota Semarang didirikan sebagai salah satu usaha untuk ikut serta berpartisipasi aktif dalam mencerdaskan kehidupan bangsa, meningkatkan kualitas manusia Indonesia, yakni manusia yang beriman, bertaqwa, berbudi pekerti luhur, berkepribadian, mandiri, maju, tangguh, cerdas, kreatif, terampil, berdisiplin, beretos kerja, profesional, produktif, serta sehat jasmani dan rohani.